军事在嘉庆初中制之最谬者，为严斥明亮、德楞泰奏请筑堡守御事，事在二年九月，《东华录》竟不载，清国史《明亮传》《德楞泰传》亦无之。《圣武记》：“明亮、德楞泰奏言：臣等自楚入陕，所经村庄皆已焚烬，盖藏皆已搜劫，男妇皆已虏掠，目不忍见。已扰者固宜安恤，未扰者尤宜堤[提]防。查各州县在城之民，有城池以保障，是以贼匪皆不攻城。其村落市镇，仅恃一二隘口，乡勇或远不及防，或间道失守，仓皇逃避，不但衣粮尽为贼有，且备卫之火药器械，反以借寇而资盗。而各贼所至之处，有屋舍以栖止，有衣食火药以接济，有骡马刍草以夺骑更换，有逼胁之人为之乡[向]导负运。是以自用兵来，所杀无虑千万，而贼不加少。且兵力以保城为急，则村市已被虔刘；以保荆、襄为急，则房、竹、安、康已难兼顾。为今之计，欲困贼必须卫民，莫若饬近贼州县，于大镇市劝民修筑土堡，环以深沟，其余因地制宜，或十余村为一堡，或数十村为一堡，贼近则更番守御，贼远则乘暇耕作。如此以逸待劳，贼匪所至，野无可掠，夜无可栖，败无可胁，加以大兵乘压其后，杀一贼即少一贼，灭一路即清一路。近日襄阳绅士梁有谷等，筑堡团守，贼屡攻不能犯，此保障之成效。至川东各属，多有险峻山寨，只须令乡民临时移守其中，一如守堡之法，于以御贼安民，必可克期扑灭。”奏上，虽奉旨以“筑堡烦民，不如专禽[擒]首逆”，而坚壁清野之议实始此。魏氏不指当时之失计，而以后卒筑堡收功，谓实始于此。《史稿·本纪》：“十月戊戌，初二日。明亮、德楞泰请广修民堡，以削贼势，诏斥其迂缓。”而列传不见此事，可知《实录》本无，而《东华录》自无可录矣。
是时情况，据九月癸巳谕：“闻近日匪至一村，先将年壮平民逼令入伙，遇官兵辄令当先，贼匪随后接应。当先者被剿败，匪即先窜。官兵杀掠报功，节次折称杀贼无数者，皆逼胁平民，而真匪早远扬，所以日久不能成功。而新起入伙之贼，未必不由官兵驱迫所致。”至十二月癸亥，勒保奏言“贼匪随处焚掠，即随处勾胁，是以日久愈多。川、陕、楚三省犬牙相错，数千里崇山峻岭，处处有险可恃，有路可逃。及官兵择隘堵御，贼又向无兵处滋扰，致有贼之地无兵，有兵之地无贼，并有贼过而兵未来，兵到而贼已去者。东剿西窜，南击北驰。以言兜剿，即数十路难以圈围；以言堵御，虽数十万兵亦不敷分布”等语。其为清野之法不行，清军以备多而见少，教众以所向随意而见多。徒以朝旨急于灭白莲教，不许先为灭之之备。虽亦真有奏捷之时，清军亦屡丧敢战之提镇大员，得失略相当耳。三年正月，以明亮、德楞泰追剿高均德，责其不先歼齐王氏、姚之富等，尽夺世职及优赏，止留本职戴罪图功。二月，并将明亮革职，拏[拿]交刑部治罪。而是时，明亮、德楞泰已破齐、姚于郧西，齐王氏及姚之富皆陨崖死。谕尚以未能生擒为不满，且言：“此时陕省首逆系高均德、李全，其次即张天文、阮正通，不可再令自毙逃戮。”
教之炽也，由于吏虐，仅凭教徒鼓众之口，实未可为信，教众之扰则有反证焉。四川南充县知县刘清，以贵州广顺拔贡官蜀，适当扰，清数以乡兵破之，所抚兵民，皆以儿子畜之。人乐为死。教众自为民时知清名，战莫为用，故遇清辄逃。教众分青、黄、蓝、白为号，白号首领王三槐横于蜀，总督宜绵命清亲入三槐营，三槐跪谒清，随至谒督，约率所部出降。清知降非诚意，设备以待。三槐于所约纳降之日，诡来投，所伏教众沿途接应，将为掩袭计，清大败之。此二年四月事也。三年，总督勒保受命专责剿办三槐，委清署广元县事，再议抚三槐，令清迭赴三槐营宣谕。三槐诣军门，勒保擒以奏捷，符诏书“生致首逆”之旨，勒保由侯晋公，晋和珅由伯为公，封珅党福长安爵侯。时距平乱尚远。只得教中首领之一耳，赏亦不及刘清。清既为总督所卖，然有所招徕辄遣清，清仍累至白莲教营，教众惩三槐事不敢出，以清廉吏，不忍加害。其非著名头目信清者仍夥，前后招降川东教众二万，皆遣散归农。清所练乡勇尤敢死，尝破罗其清、冉文俦于方山坪，破三槐于巴州江口，转战川东数载，大小百十战，斩馘万计，见奏牍者十仅二三。三槐被绐俘至京，廷讯时供：“官逼民反。”帝问：“四川一省官皆不善耶？”对曰：“唯有刘青天一人。”于是刘青天之名闻天下，以军功累进官至建昌道。嘉庆十年教乱已平，清入觐，仁宗赐诗，首有“循吏清名远迩传，蜀民何幸见青天”之句。丁艰起复，授按察使，升布政使。自陈才力不胜藩司任，恳开缺，斥其冒昧陈奏，降补员外郎。十八年，清已补山东盐运使，天理教李文成起河南，煽及山东，清再从戎，以破扈家集功最，谕以布政使缺与伊不甚相宜，以二品顶戴留运使任。二十一年，因病请开缺，令来京医治，旋授山东登州总兵，调曹州总兵。年老休致回籍，奉旨入祀贵州贤良祠、山东名宦祠，给子孙荫。
川、楚之役，以刘清事为最奇特。尤奇者教众皆颂刘青天，被斩馘而不仇，被招抚失信而不怨。非一二教目之特性，盖凡教众皆戴青天，然则良民之尽礼于贤长官，能过是乎？且能及是乎？以如此有性情之教众，而卒不乐为良民，是可知官逼民反之非借口矣。当三槐供及刘青天时，太上尚训政。明年正月太上崩，和珅获罪，仁宗谕“教匪滋事，以官逼民反为词。昨冬贼首王三槐解到，讯供亦有此语，闻之恻然，是以暂停正法。我国家百数十年厚泽深仁，皇考临御六十年，痌瘝在抱，普免钱粮漕粮，以及蠲缓赈贷，不啻亿万万，百姓安土乐业，焉肯铤而走险？缘亲民之吏，不能奉宣朝廷德意，激变至此。然州县剥削小民，不尽自肥己橐，半奉上司；而督抚之勒索属员，不尽安心贪黩，无非交结和珅。是层层朘削，皆为和珅一人，而无穷之苦累，百姓当之。见[现]在大憝已去，各省官吏，自当大法小廉，湔除积习，民无扰累，可遂其生”等语。盖已认“官逼民反”之语为真，而一委其祸本于和珅，或未可尽其事理。以廉吏仅得刘清，而不用以整率百僚，乃使浮沉吏议，至不欲为藩司之官，改武职而后守职数载，仍以老休致，一以寻常礼数待之，视康熙时之激浊扬清，使成风俗，度量之相越，何其远也！故知去和珅为积年隐忍之憾，非真为去吏治之蠹也。国家爱惜廉吏之心，尚不如三省普遍之白莲教众。以吾辈今日计之，若以异等之礼待刘清，以能识刘青天之良心奖教众，直使清主兵号召之，大甄汰地方长官，大筹措归农生计，或不至更阅五六年，而后仍以武力靖乱。不数年，络续教乱，兵及宫廷，知守文之主，果不足与大有为也。
二月辛卯（初四日），又谕：“自川、楚邪教逆匪滋事以来，所过劫掠焚烧，迫胁煽惑，良民不得已从贼日多。奔驱三载，不能自拔者数逾十万，室庐焚荡，田亩抛荒，欲返无所归，即归无所食，势不得不托贼巢栖身，借盗粮糊口。此非徒作招抚空谈，能收解散实效者也。前经降旨，剿抚兼施。大约谓自古惟[唯]闻用兵于敌国，不闻用兵于吾民，自相攻击，屠戮生灵。朕日夜哀怜，几废寝食。百姓极困思安，久劳思息，谅必一见恩旨，翕然来归。第思既归之后，目前何以食？将来何以居？务使此番安集，即成永远规模。设非虑及，他时恐倍难于今日。凡从各股贼匪中受抚来归者，应如何绥辑安插之处，令勒保就近传唤同知刘清及川省素有清名之州县，俾其悉心妥议具奏。刘清既素谐民望，必能深识民情。他乡流落者，如何资送还农；失所无依者，如何编丁占籍。朕几余检阅《明史》，成化中，项忠、原杰先后办理荆襄流民一案，具有章程，或可采取其法，施之当今。或因事异时移，不宜泥古，可一一详细奏闻。至陕省抚辑情形，马慧裕新授藩司，正伊职分中事，亦着详议具奏。”此谕亦知从官逼民反之后，求其症结而理之。顾首称“邪教逆匪”，意少矜怜，既不重视刘清，仅与他州县同被勒保传唤，即非有清勇于任事之地。在受抚者意中，见传唤者为旗下纨绔之勒保，被传唤者有腼然与刘青天并列之多员，固已索然意尽矣。项忠与原杰并称，前例已未能确辨性质，固知其知识在明昧之间。既知贪污害民，不向百姓告罪，而作此是非蒙混之语，知乱事之不能豁然立解也。清居官廉，逢陋规必裁，为大吏所不便。任州县所碍大吏者仅一州县，若任藩司则碍一省矣。清后为藩司，勒保即劾以“民社有余，方面不足”，改降运使。清知若任财赋，终不见容，致改武职去，帝竟听之。编修洪亮吉于四年上书，即云：“进贤退不肖，似尚游移。刘清尚为州牧，仅从司道之后办事，似不足尽其长。”亮吉几杀身，特宥犹获遣戍，刘清则终不大用，此足以见仁宗之持国是矣。
筑堡御守之策，二年已被斥不行。及仁宗亲政，有兰州知府留川督宜绵军中充左翼长之龚景瀚，复上坚壁清野之议，备陈调兵、增兵、募勇三害，征剿四难。谓：“先安民然后能杀贼，民志固，贼势衰，使之无所裹胁；多一民即少一贼，民居奠则贼食绝，使之无所掳掠。民有一日之粮，即贼少一日之食。用坚壁清野之法，令百姓自相保聚，贼未至则力农贸易，各安其生；贼既至则闭栅登陴，相与为守。民有恃无恐，自不至于逃亡。其要先慎简良吏，次相度形势，次选择头人，次清查保甲，次训练壮丁，次积贮粮谷，次筹划经费，如是行之有十利。”反复数千言，切中事理。嗣是被兵各省，举仿其法，民获自保，教无所逞，成效大著。论者谓三省教众之平，以此为要领（以上《史稿·循吏·景瀚传》）。《史稿·循吏·景瀚传》略具全文，不备录。四年六月，庚寅（初三日），诏曰：“朕闻湖北随州，未被贼扰，因民人掘沟垒山，足资捍御，民间村堡，尽可照办。勒保、松筠、吴熊光，即晓谕百姓知之。”时勒保为经略，松筠督陕甘，熊光抚河南，四川则勒保兼督，湖北则勒保经略所在也。十一年，续修《皇清文颖》，仁宗出此议付馆臣载入，盖深赏之，而明亮、德楞泰前所奏为始行矣。
先是谕斥清野策为迂缓，严敕诸将力战。三年正月，擒覃加耀，以蒇事缓，夺额勒登保爵职。六月，破齐王氏、姚之富，逼令陨崖死。七月，擒罗其清，又斩冉文俦，又诱擒王三槐，遂封拜勒保、和珅、福长安等，并释勒保弟永保于狱，而教乱仍如故。四年，仁宗亲政以后，三月，斩萧占国、张长更，又胜冷天禄一股，额勒登保迭进爵至一等男。七月，斩包正洪。八月擒龚文玉，又擒卜三聘。九月，毙汪正漋。十月，德楞泰擒高均德，封二等男，授参赞大臣。德楞泰前亦夺爵职。十二月，擒王登廷。五年二月，毙王金桂。三月，擒冉天元，晋德楞泰三等子。四月，歼教首雷士玉、孙嗣凤。五月，以歼净陕西教首刘允恭、刘开玉，擒获头目王洪儒，晋额勒登保三等子。七月，教首刘之协就擒于湖南宝丰，讯明正法。八月，歼毙教首伍金柱、宋麻子。九月，毙教首唐大信。十月，获张子聪。十二月，歼教首杨开第、齐国谟。六年正月，毙教首张世陇等，又毙徐万富等。二月，射死王士虎，生擒王廷诏。四月，擒教首高三、马五及马五之子，余众悉平，并前擒王廷诏功，晋额勒登保二等子，予提督杨遇春骑都尉世职。德楞泰又击毙教首张允寿。六月，德楞泰等追剿青号教众，淹毙首领徐天德。额勒登保等擒张天伦、伍怀志。七月，吴熊光等毙白莲教首王镇贤。勒保奏擒徐天寿、王登高等。八月，勒保擒冉学胜等，赏还一品顶带（本年四月，革勒保翎顶），封三等男。是月，以三省大功将蒇，撤盛京兵归伍。十月，额勒登保擒辛斗及总兵苏启志。德楞泰击毙龙绍周。十一月，额勒登保奏督剿通江一带，擒获元帅冉添璜、头目庞思宇等，又擒高见奇、周万友等。十二月，额勒登保击毙头目苟朝献。七年正月，额勒登保擒辛聪。吴熊光等擒青号教首张允寿之子德贵。二月，额勒登保奏道员刘清擒李彬及辛聪之弟辛文。三月，勒保击毙张天伦、魏学盛及其元帅陈国珠等。德楞泰截击线号教众，毙其首领龚其尧，擒老教师李世汉、李国珍等。五月，勒保擒庹向瑶并老教掌柜徐天培、张思从及头目多名。庆成擒元帅康二麻子、总兵张昌元等。六月，德楞泰击毙樊人杰等并其妻子弟侄，晋三等侯。勒保击毙杨步青。七月，勒保又歼除黄、白、青、蓝四号教众，擒刘朝选，晋一等男。额勒登保击毙苟文明，晋一等伯。勒保击毙楚省教首赖先锋，扑灭全股，并兜截张长吉一股。十二月，额勒登保、德楞泰、勒保、惠龄、吴熊光等奏报川、陕、楚一律肃清。自成亲王、仪亲王以下，论功行赏有差。额勒登保、德楞泰俱晋一等侯，勒保、明亮俱一等男，赛冲阿、杨遇春俱轻车都尉世职。八年，诏四川、湖北、陕西、甘肃、河南被扰各州县，自元年至七年，带征缓征逋欠钱粮，普予豁免。