第二节　分子鉴定技术的优越性

通过选择不同基因的DNA序列片段，即可得到不同分类水平上的区分特征——DNA条形码。由于某些特定的基因序列如5S-rDNA非转录间隔区（NTS）、ITS高度可变，只能成为植物“种”一级水平的分类鉴定分子标记，而某些保守基因如核基因组18S-rDNA序列则可用于“科”一级水平的分类鉴定分子标记。除动植物DNA序列和条形码外，尚有AFLP、DALP、RAPD等指纹图谱分子标记用于整个基因组的多态性检测。

DNA序列作为所有生物体最基本的遗传识别单位，即使由于错误复制导致基因突变，细胞仍有恢复其DNA序列的修补机制。相反的，蛋白质、次生代谢产物以及化学成分均为DNA的表型产物，它们的表达及组成明显地受到生长环境以及生长年限的影响。由于DNA序列中的每个核苷均可作为独特的标记，通过检测信息丰富的数百个碱基组成的DNA片段，就可鉴定得知某一药材的基原。这对地道药材的鉴别尤显重要，因为许多中药的药效易受地理分布的影响。同时，由于分子生物学领域分析仪器的商品化，导致价格不断下降，使得越来越多的实验室可方便购置所需的仪器如电泳仪、PCR仪、DNA测序仪进行DNA分子鉴定实验，这也是DNA分子鉴定成为法定方法的前提条件。