除脂质代谢紊乱外，有多种遗传因素明显易致动脉粥样硬化。从家族史分析除了累及脂质代谢的基因之外，几乎没有基因有如此大的影响。最近发现了两个导致冠状动脉疾病的基因，一个为可同时导致弹性假黄瘤的ABCC6，另一个是功能不明的KLOTHO。然而，易患高血压和糖尿病的基因，控制动脉直径、反应性、分支角度，影响血小板黏附血栓形成和纤溶，调节内皮细胞和平滑肌细胞功能的基因均被认为是有动脉粥样硬化倾向家族的候选基因。研究更多易发生突变及多形性的基因以提供更多的风险信息，此可行性已愈加提高。