心肌桥临床表现多种多样，差异较大。许多患者可长期无明显症状，也有不少患者有心肌缺血表现，特别在劳累、运动、情绪激动时，心肌缺血症状加重，可导致心绞痛、室性心动过速、房室传导阻滞、急性冠脉综合征、心肌顿抑（即心肌短时间内缺血再灌注后出现一过性可逆的收缩功能降低），甚至心源性猝死。大部分患者多于劳累或活动后发生，也有于夜间睡眠、情绪激动时发生。其症状各异，较常见的为不典型胸痛和劳力性心绞痛，且使用硝酸甘油疗效欠佳，有的使用后症状加重。目前认为其轻重程度不同的临床表现与冠状动脉受压程度有关，一般认为心肌桥压迫性狭窄超过40%时可出现胸闷、胸痛等心绞痛症状。心肌桥合并近段血管病变的患者临床症状亦较明显。此外，心肌桥还可与心肌病、冠心病及心脏瓣膜病等其他器质性心脏病并存，使临床表现更加复杂化。