由于遗传因素和抗原种类的不同，红细胞膜上的抗原位点数也有所不同。抗原位点数影响红细胞对相应抗体的反应强度，抗原位点数多的抗原性强，在医学上也更为重要。ABO系统的A、B抗原位点数远高于其他系统的抗原。

当控制某血型抗原的基因为纯合子时，其红细胞上的该抗原为“双剂量”，为杂合子时，其红细胞上的该抗原为“单剂量”。相应抗体与纯合子的红细胞反应强，抗体的反应效价高；与杂合子的红细胞反应强度弱，抗体的反应效价低，这种由于等位基因数量不同所致的抗原表达上的差异现象称为剂量效应（dosage effects）。剂量效应在共显性基因的情况下发生，在MNS血型系统和Rh血型系统，剂量效应比较明显。

几个基因在成对染色体上的位置相互影响，称为位置效应。这种影响如果发生在同一条染色体的基因之间，则产生顺式效应；如果发生在同源染色体的基因之间，则产生反式效应。位置效应主要发生在Rh血型系统，弱D型形成的原因之一就是反式效应。如当基因型为 CDe/cde和 Cde/cDe时，两者表型相同，但后者产生的D抗原比前者弱，是后者一条染色体上的C基因对另一条染色体上的D基因的影响，为反式效应。而cDE基因复合物产生的E抗原量比cdE基因复合物产生的E抗原量少，这是同一条染色体上D基因的影响，为顺式效应。

有些基因复合物控制的相关表面结构称为复合抗原，能引起免疫应答，产生复合抗体。如基因CDe的产物有C、D、e三种抗原活性，同时也有Ce抗原活性。复合抗体只与复合抗原反应。