前面的剧情什么的，我也就不多说了，从接下来的故事开始。
鼬寻得石斗后，石斗拜托黑绝哪里整来了之前镜的资料，然后给鼬分析了一波镜死于木叶高层，鼬当场开万花筒，随后听从石斗的计划。
止水随后袭击火影大楼，三代火影负伤，随后逃亡，逃亡过程中被带土发现，并且招募进入晓组织。
木叶震怒，准备直接拿宇智波一族开刀，富岳为保卫宇智波暴露万花筒，但依旧无法平息木叶的愤怒，无奈之下鼬也使用万花筒，至此木叶不在追究。
同时日向一族与木叶裂痕更大，这件事牵涉到了之前日向日差，因此宁次比原著更加孤僻，只有对雏田的时候比较正常。
止水进入晓组织之后不认同长门的和平理念，随后跟随外围成员，枇杷十藏一起前往雾隐村执行任务，期间再次与枸橘矢仓一战，动用了万花筒瞳术，胜。
枸橘矢仓随后被带土使用幻术控制三尾，从查克拉改变枸橘矢仓的意志，一个月后被石斗借青的白眼发现，随后要求二次检查，从而彻底破解带土的幻术。
石斗以影级实力逼迫元师，同时拥有水无月和辉夜，以及鬼灯三大族的支持，一举成为第五代水影，同时让枸橘矢仓负责大部分事物，自己做大方向的决策。
至此雾隐村彻底中兴，尸骨脉开始崛起，这本书结束。
好了铁子们，下面的就不要看了，可能影响你的火影世界观。
由石斗操手，与木叶，砂忍三方联合举办中忍考试，君麻吕，水月，香磷一队，由鬼鲛带队，长十郎，林檎雨由利，水无月白一队，由再不斩带队。
中忍考试途中联合砂隐对木叶发起进攻，木叶勉强抵挡，随后根部暴露，砂隐和雾隐陷入下风，最后宇智波反叛将死木叶高层。
战争结束宇智波一族成为第五代火影，日向一族搬入雾隐村，木叶沦落五大国之首，云隐想要趁火打劫，不料被晓组织偷掉俩个人柱力。
鸣人迷茫之际，石斗上前劝说鸣人，希望鸣人成为自己的助力，没想到触及阿修罗，阿修罗强行占领控制权，与石斗一战，石斗暴露出血继淘汰，皆杀骨，随后胜利，将阿修罗意识封印。
六道仙人暴怒，从净土归来，要清洗这个忍宗，被羽村以死亡的代价拦下，随后舍人进入忍界，为了辅助石斗拿下忍界的所有权。
石斗对忍宗制度宣战，控制整个雾隐村与四大国宣战，并且与带土达成共识，更名为甲，守护忍界之使命。
第四次忍界大战开始，因陀罗引导佐助加入雾隐村，无奈被鼬发现，随后交由石斗交涉，从而因陀罗成为消灭忍宗的一大助力。
同时指导舍人开启转生眼，宁次开启转生眼，第四次忍界大战彻底打开。
秽土转生出的忍者，全力以赴与六道仙人一战，终于在付出了惨重代价，辉夜姬正常复活，不过黑绝被石斗强行封印，与辉夜姬交涉之后，改变了辉夜的错误。
忍界结束了忍者时代，彻底进入真正的和平。
————————大结局啦————————
至此已经大结局了，至于剩下的什么奇奇怪怪的东西，你们不看也罢。
————————不建议看————————
数年之后，石斗斩杀一直猥琐发育的一式，捏造事实，与桃氏一战，碾压桃氏之后，提成返回大筒木的要求，最终进入大筒木一族，在和浦氏的交锋中，胜利，获得纯血大筒木的身份。
通过大筒木一族最强者得知，辉夜前往星图的原因后，返回忍界，踏入净土寻找穿越之谜，终于找到了空间裂缝，里面有一位白衣青年。
青年解答了石斗的所以疑问，并且邀请石斗为蓝星的未来贡献一笔，石斗拒绝之后留下空间坐标，偶尔偷偷前往蓝星观察一番，自己一直待在忍界。
最后忍界和平相处，大家快乐一批，好基友也获得了永生，并且给人们留下了值得他们耗费上万年探索的科技。
全篇完。