方腊带着方杰等人逃出杭州后，深深感西军的强大，本想蛰伏起来。可是逃到睦州发现这里的寒热重症疫情非常严重，方腊自认为有阿芙蓉膏在身，并不怕疫情。相反他认为疫情会让西军寸步难行，所以在睦州再次召集教众起义。
睦州由于已经被劫掠过一次了，所以这次起义方腊并没掠夺多少钱粮。正在此时童贯引着宋军前来围剿，这下子给了方腊机会，方腊出动神兵将童贯杀败，取得了不少的粮草。但是西军中环庆军还是给方腊军队带来了很多麻烦，使得方腊无法击退宋军。
后来方腊听说环庆军是疫情最严重的军队，还凭借着残兵抵抗住了自己的进攻，心中暗暗胆寒。后来听说种师道再次领着西军精锐南下，他知道仗已经打不下去了。于是他将劫掠来到粮草、还有部分阿芙蓉膏交给了的干儿子方博，让他指挥者部队往南撤退，当粮草和神药用尽后，再到歙州与自己汇合。
歙州实际上是方腊的老家，他在睦州起义的时候也占领了歙州，但是对待歙州并没大规模的劫掠，所以歙州还是比起其他州县还是非常繁华的。方腊逃到了帮源洞，占据了天王庙。帮源洞实他秘密种植阿芙蓉的地方，他起义后就在安排了几十个人把守，这些人都是对他都是忠心耿耿。杭州兵败以后，这几十个人的粮饷就断了，但是他们没一个人逃走的。方腊和方杰也带了几十个人到了帮源洞，在帮源洞很快了100多人，因此吃饭就成了问题。
方杰的意思是歙州还有些钱粮，应该带人再次起义，攻占城池，劫掠财物。但是方腊觉得，西军在江南不会长久，需等等西军返回西北后再行起义之事。为了解决财政的危机，他们故技重施，利用天王显圣的骗局每月初五、十五、二十五在天王殿燃后阿芙蓉，用阿芙蓉的香气迷幻信徒。石佛出土也是他们的骗人伎俩，他们买了18尊石佛埋在地下，石佛地下铺上黄豆，给石佛浇水让黄豆出芽，既可以将石佛顶出来。用这些手段方腊等人一个多月，就敛财3000贯。
此时方腊和方杰正商量着离开帮源洞的事情，这个倒不是方腊他们发现了王三他们，而实方腊觉得再装下去，可能会引进官府的注意，引火上身。
方腊对方杰道：“这一个多月咱们就收获3000多贯钱，咱们也该挪挪地方了。”
方杰道：“要不在等几天，那阿芙蓉马上就可以再次割汁，多带些上路才好。”
这阿芙蓉的种子就是方腊偶然从番商那里买到的，他开始只知道炖肉时加入这种种子，可以使得猪肉非常鲜美，后来他试着种了一些阿芙蓉。由于他是漆工出身，懂得割漆树汁液制漆的方法，慢慢他发现这个阿芙蓉也可以像制漆一样制成黑稠的膏体。而且他发现这种膏体几乎可以治疗所有的疾病。其实在古代，只要是能够身体不痛都算是病好了，阿芙蓉膏就是有强烈的阵痛效果。后来他又发现，人们过量服用阿芙蓉膏后可以产生幻觉，不畏生死，于是就借着疫情传播摩尼教，自封为圣公，最终占领杭州建立永乐政权。阿芙蓉可以说是他起家的最大依仗。
面对方杰的建议，方腊想了一会道：“不等了，阿芙蓉的种子还在，到那里都能都能种出阿芙蓉。最近上山的人太多了，早晚引起官府的注意，再者出土石佛的把戏也演不了多久了。”
方杰点了点头道：“那方博呢，不等他了？”
这个方博原名叫方毫，实际上是方腊的亲儿子。只是起义以后他为了保护方毫，才给他改了名字。这次他方方毫南下作为疑兵，而带着方杰在身边，他也是下了很大决心的。对此他内心深处对方博是有亏欠的。要不是因为等待方博，方腊早就走了。
方腊黯然道：“从睦州撤退已经月余了，他要是回来早就回来了，此刻只怕……哎，他自求多福吧。咱们赶快收拾一下细软。吃过午饭就走。”
方腊和方杰正在说话的时候，突然一个方杰的一个亲兵闯进洞内。方腊非常恼怒正要怒斥，那个亲兵喊道：“不好，圣公，不好。”
方腊猛地站起身来，道：“怎么了！”
那个亲兵道：“我今日早晨道山下采买粮食，听说山下村民说清溪镇来了大队的官军。我急忙往清溪镇方向探究，在半路上就遇见了宋军大队人马往这边过来了。看旗号是西军！我抄小路过来报信，恐怕此时西军就快上山了。请圣公早做安排。”
方杰听罢，猛地抄起方天画戟，道：“圣公，不如跟他们拼一个鱼死网破！”
方腊道：“这山上还有多少上香的香客。”
方杰道：“今日是二十三，不是天王显神的日子，天王庙前只有几百人在拜出土石佛！”
方腊一咬牙，道：“去把天王庙和仅存的所有阿芙蓉膏都点燃，告诉香客说是官府前来灭教，天王发怒了，让他们赶快护教。咱们乘乱从后山小道走。”
种师道、吴麟等人已经到了山下，他们突然看见山上已经浓烟滚滚了，空气质飘着一股异香。
王三道：“就是这种异香，可以迷人心性。”
种师道看了一眼吴麟，道：“方十三就在这里，把山围了，务必擒拿此人。”
西军有1000多人，天王山又不大，霎时间被西军围了起来。种师道带人，在王三带领下的带路下，开始上山拿人。
在山口设卡收费的那几个起义军的士兵，见到西军转身就跑，早有几个西军追上去将他们砍翻在地。众人顺着顺着山路就向天王庙攻了上去。
天王庙前的几百个善男信女还在对着出土石佛跪拜，这时候天王庙突然起火了，一股异香就飘了出来。这些香客都惊呆了，因为他们知道只有在天王显神的时候才会有此种异香！此时方杰带领一些起义军士兵从庙门里冲了出来，对着香客们喊道：“朝廷大军前来抢劫了，天王发怒了，各位香客赶快护教，冲下山去才有活路。”
听了方杰的喊话，香客们一阵大乱。有些已经被方腊蛊惑的香客，居然随手抄起了身边的木棍、石块等往山下冲。方杰对自己身边不多的起义军也下了死命令，道：“生死之属，存亡之理，就在今日一战。冲杀下山去还有活路，否则落入官兵之后，将死无葬身之地。”
这百余起义军都是跟官军厮杀多场的老兵了，他们也知道这个道理，所有也就只有拼命这一条路了，因此也跟在香客的后面往山下杀去。
方杰却没有跟着起义军往山下冲杀，他带着几个亲兵保着方腊，从后山的秘密小路溜走了。西军从山下往山上攻打，路上遇见了一些下山的香客。西军对着香客吆喝道：“官军拿贼，跪地免死。”
冲在前面的香客有受到了方杰蛊惑的，用木棍、石块攻击西军，西军那里顾及这些，用刀砍翻了当头的几个。后面的香客看到此时明白了西军不好惹，纷纷跪在路边让出一条道来。香客后面的就是百余人的起义军最后的残部了，这些人已经成了亡命之徒，高举刀剑向西军发起最后的冲锋！
这种冲锋往往是徒劳，西军人多势众，战法纯熟，远非一年前还是农民的起义军可以比的。几个回合下来，这些起义军死伤大半，还有些被当场擒拿。种师道见战斗结束比较顺利，叫人寻找方腊、方杰的踪迹。自己率领一队人马直奔天王庙。
种师道到达天王庙的时候这个庙已经是大火冲天，无法施救了。种师道暗自担心，生怕方腊举火自焚。这是有人来报，说是在天王庙后发现了帮源洞。
种师道带人进入帮源洞，这里显然是有人居住的痕迹，从地上散落的铜钱看，这里的主人走到相当急促。先前进洞的官兵像种师道报告，道：“启禀经略相公，这洞中有残存的铜钱将近3000贯，可能是贼人走到慌忙没来得及带走。”
种师道回头问王三道：“你确认这个山只有一条上山路吗？”
王三道：“小的这几天一直在山下的村子里住着，跟山下的村民确定了多次，天王山就有一条山路。”
种师道吩咐道：“既然如此，仔细搜查，一定要找到方杰和方十三，活要见人死要见尸！”
这时候，又进来一个官兵报告道：“启禀经略相公，后山发现了一片的土地，上面种着一种怪的花。”
种师道带着众人来到这片花田，果然在一块几十亩的土地上，盛开这一朵朵非常艳丽的花。西军众人都不知道这是什么花。
吴麟感叹道：“好漂亮的花。”
种师道虽然没有亲眼看见过这种花，但是后世的扫毒的纪录片他可没少看，他脱口而出：“罂粟花！”
吴麟疑惑道：“这又是什么东西。”
种师道回道：“这就是阿芙蓉。”说完，他挥刀斩下一支罂粟花，花茎的断口出流出了乳白色的汁液。种师道指着这个汁液道：“这个汁液就可以提炼阿芙蓉。方腊时漆工出身，自然熟悉这些道理。难怪他有那么多的阿芙蓉膏”接着他仔细看了看土地，这片土地至少给开辟出来数年了，看来方腊在起义前就把这里作为秘密基地种植阿芙蓉。
这是又有官兵喊道：“这里发现了一条小路。”
种师道等人快步走上前去，只见这块花田的边缘一段非常陡峭的断崖，有几根绳子拴在了树上，断崖下明显一条刚刚被开辟出来不久的小路，直通山下。
种师道咬牙道：“好狡猾的方十三。”说罢一指那条小路，道：“给我追！”
王三由于自己没有探听得到这条小路，心中有些羞愧，第一个抓住绳子就溜了下去，紧接着又有20多人跟了下去。
胡三、林冲是带领着骑兵并没有上山，这次吴麟带了200多骑兵，种师道也从睦州带了100骑兵，胡三和林冲带着着300多人围着天王山巡逻。也是无巧不成书，当他们巡查道后山的时候，突然看见后山坡上顺着山坡连滚带爬的下来了七八个人。这些人从山坡上下来，看到西军就跑。
胡三眼尖，他为首的一人身材高大，手里拿着方天画戟，这是方杰。胡三大叫一声方杰休走，催马摇枪直奔方杰就刺了了过来。方杰对着身后大喊一声：“快走。”自己反而想胡三冲了过来，用方天画戟挡开了胡三的快枪。胡三的马刚刚越过方杰，林冲又冲了过来。林冲从来是拿枪当棒使用，举起铁枪搂头盖顶就砸了下来。方杰也是力大无穷的人物，所以并不害怕。只见他大叫一声：“来的好！”双手将方天画戟举过头顶，只听“当啷”一声两人兵器相撞。方杰由于在步下，不能像林冲那样借着马力，所以有些吃亏。他只觉得两臂给震得发麻，身不由己往后退了几步。
这是他没想到胡三兜马回来了，在他身后用枪轻轻的一扫他道小腿，方杰一个跟斗就翻到在地。林冲身后的骑兵也冲了上去，不由分说把另外几个义军诛杀殆尽！
方杰一翻身想起来，看到跟他下山的几个人瞬间被诛杀，不由得扔了方天画戟，放声大哭起来。